تأسّس المركز عام 1992، وتمّ افتتاحه عام 1994. وفي عدوان تمّوزعام 2006، تمّ استهداف المركز من قبل العدوّ الصهيوني،حيث لحقت به أضرارُ هائلة. لكن، بحمد الله، أعيد ترميمه بشكل أعاده أجمل ممّا كان.

يعتبر مركز بعلبك المركز الثاني في سلسلة مراكز الإمام الخمينيّ قدس سره الثقافيّة في لبنان بعد مركز حارة حريك.

أهميّة المركز:
مدينة بعلبك أو " مدينة الشمس " كبرى مدن البقاع اللبناني، وإحدى أعرق المدن في لبنان خصوص، وفي بلاد الشام عموماً. تشهد لعراقتها تاريخيّاً تلك الآثار الرائعة، والتي تعتبر قلعتها أعظم آثار الحضارات في المنطقة. و يشهد لعراقتها إسلاميّاً الكثير من الآثار، وعلىرأسها قاطبةً المقام الشامخ لشهيدة المسيرة الأبيّة لسبايا عاشوراء السيّدة خولة (عليها السلام).

بعلبك مدينة العلم و العلماء، والأدباء والشعراء، والفكر والثقافة، مدينة الحوزة العلمية والمعاهد. من أهم الوجوه التي عاشت في بعلبك الإمام الأوزاعي، وفريد العصور كلها الشيخ بهاء الدين العاملي المعروف بـ"الشيخ البهائي"، والشاعر خليل مطران، والشيخ حبيب آل إبراهيم، العلّامة الشهيد السيد عباس الموسوي، والعلّامة السيد حسن نصرالله، وغيرهم...

وبعلبك اليوم مركز محافظة بعلبك الهرمل، وهي ذات حضور سكّاني شديد التنوّع طائفيّاً ومذهبيّاً وسياسيّاً. من أجل ذلك كلّه، استحقّت أن تحتضن هذا المركز الثقافي الذي تشرّف بحمل اسم الإمام الخميني " قدس سره ".

أقسام المركز:
المركز مؤلّف من أربع طبقات موزّعة كالآتي:
1- قاعة سفليّة كبيرة وهي المكتبة العامّة. تقدّم الخدمات المجّانيّة للطّلّاب والأساتذة والعلماء والباحثين
2- مكتبة الإنترنت وهي تقدّم خدماتها مجّاناً.
3- الدّيوانية الأدبيّة والثقافيّة.
4- قاعة كبيرة مخصّصة للأنشطة الثقافيّة التي يعنى المركز بإقامته، وهي تحوي مسرحاً.
5- قاعات للتدريس.